2016.5.1集结之园，学社。在修养了大约一个月之后，碇真嗣重新到校上课了，明日香那边由于透支厉害还得住院疗养，雾岛真名倒是没事，但因为那天过于明确地表达了自己的心意,听说他今天来上学之后，因为太过害羞没能调整好心态而翘了社团活动，至于
“真希波”，她根本就没有加入学社。所以，今天的社团教室里只有碇真嗣和绫波零两人。
蓝发红眸的少女坐在窗边静静地看书，这几乎没有变化的情景给人一种莫名的安心感，碇真嗣端着自己倒的茶一边喝一边想道。
说真的，明明已经抵达了前所未见的世界线,但周围的环境看起来和之前几乎没有什么区别。
这主要是因为
“第叁次冲击”发生在
“闭锁空间”内，对外界的影响微乎其微，而
“夏娃”无法再启动
“星球生命重塑程序”这种事，根本也无从验证。同时，光环形状的第十六使徒在外界只出现了一瞬，几乎没有留下影像资料，被当做UFO之类的怪谈传了一阵子，热度就过去了。
而顶替它的编号的，十二架一组的EVA量产机，由于外形同第六使徒过于相似看起来像一个个长了手脚的鱼竟然没什么人怀疑。
普通人只会感叹一下，嗯，NERV又击败了一次使徒。碇真嗣不清楚地联和NERV是怎么扯皮的，对方持有的观点似乎是：制造那些量产的EVA只是为了避免把鸡蛋装一个篮子里，属于应对NERV可能被使徒打败的后备计划，并没有攻击NERV并取而代之的意图。
另外，他们给抓获的相田剑介扣了个集结之园培养出的，能控制心智的
“超能力特工”的帽子,并指控他潜入军部重地图谋不轨。NERV方自然不会认账：简直可笑，所谓不轨的图谋就是控制EVA量产机攻击自己的大本营是吗？
如果你们没有事先安排好攻击计划和能快速抵达第叁新东京市的渠道,怎么会被影响区区几个人就能顺利发动攻击？
整体的谈判局势，由于地联那边确实理亏，又有碇唯在内部挑事，NERV一方非常占优，最终似乎按着地联军部的的脑袋签了不少大占便宜的合同，不过这就不是他作为驾驶员能知道的事了。
至于地联军方那边，似乎出于宁死不吃亏的目的，扣下了相田剑介不准他离开，还把转学手续都办好了，不用想，那些人一定是看中了他
“可以在别人视线里消失