1901年《西巴布亚军事力量》指导方案共分三部分建设内容。
条例一：建立秦明为首地军事指挥机构，包含总参谋部、军事情报部、后勤装备部、新兵训练部、军事法庭部、军事学院等部门，并逐步完善各部门机构。
条例二：建立陆海作战兵种体制，依据当前实际情况，建立陆军、海军、特种兵三大主要作战力量，陆军包含步兵、炮兵、骑兵、通信兵、防化兵、工程兵等兵种和专业部队，海军包含水面舰艇部队、潜艇部队、岸防兵、陆战队等兵种和专业部队，特种兵属于最高领导人直属部门，为专业特殊作战部队，由陆海兵员中选拔军事素质最优秀、政治立场最忠诚兵员组成。
条例三：建立兵员预备役体制，以建设兵团、武警等形式完善预备役体制，确保作战兵员及时补充。
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以上是秦明建设军事力量的三大方面，当然依秦明当前地资源和条件，尚无法完全建立起来，主要原因缺乏人才，但是这本指导方案是以后华人帝国军部建设大岗。
落实到细节，首先秦明要建立起指挥机构，以托武备学堂、留学军事学员为基础，把参谋部建立起来，以便在未来战争中组织作战，由于军情学员尚未毕业，故参谋长一职暂由秦明担任。
同时，秦明抽调中央情报局部分骨干建立军事情报局，简称军情局，直接向参谋部和帮明负责，局长由一期护卫队员秦枫担任。
另外以前秦明粗糙地护卫训练方式，也被整理成《新兵操典》指导手册，全部内容重新规范。
新兵主要训练：队列、擒敌、战术、体能。
射击训练为练习100米站卧蹲三姿精度射击，投弹训练（仿手榴弹地铁疙瘩），唯一不同的是海军部队多了1000米游泳的科目。
队列训练包括：单兵队列、集团队列、军姿仪表等。
擒敌训练包括：姿势、步伐、拳法、腿法、防击打技术、擒拿以及拼刺刀等内容。
战术训练包括：单兵战术有卧倒、持枪卧倒、端枪卧到、运动姿势为低姿匍匐、高姿匍匐、侧身匍匐,、高姿侧身匍匐、滚进（停止间滚进和行进间滚进）等；集体战术排除阵列对射战术，采用使用的散兵作战小组制，每三至五人为一个战斗小组，分散出击相互配合，进攻时以班排为最小作战单位，依次掩护、交替出击、梯子配置，减少被射击面积，降低伤亡率。
体能训练包手：五公里越野、百米冲刺、蛙跳、俯卧撑、组合体能练习等。
另外还有思想教育训练，为了保证这支军队的绝对控制权，每周五下午两个小时的时间，接爱军人的价值教育，还要学习军歌，保密条例，内务条例，队列条例，纪律条例等等，其中纪律的第一条就是坚决拥护和执行最高领主秦明的命令。
这些都是后世非常完美的新兵训练方案，可以说是领先这个时代的了，当然更深层次的战争协同作战、集团作战等内容，秦明计划有机会请德国军官教导。
兵种专业技能训练，步兵科：专业训练射击、体能、擒敌、格斗、枪械保养等各种军事技巧。
炮兵科：二十世纪初世界还奉行大炮战争主义，秦明也十分认同火炮是战争之神的说法，在战场上最容易造成大杀伤的就是炮击，因此秦明重点加强了炮兵的要求和建设，主要包括炮兵技术训练和炮兵战术训练。
技术训练包括炮击、兵器与操作（包括火炮、弹药和技术装备的性能、构造、工作原理和操作使用、维护保养），炮兵侦察测地、气象和建立地缘坐标,炮兵通信,工程保障,驭术等。
炮兵战术训练包括：合同战术原则、炮兵战斗基本原则、战斗指挥、战斗保障，攻防作战中炮兵战斗行动和专业兵之间、兵种之间的协同训练。
工兵科：主要是学习遇山开山，缝水架桥，构建营地等。
后勤科：主要是学习如何保障部队或者基地的粮食、水、弹药补给等问题。
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作为最重要地作战部队建设，考虑到西巴布亚岛屿，几乎没有陆上敌人，秦明当前面临海上的危险最大，所以海军建设为主，陆军建设为辅，计划海军人员为八千人员，陆军为五千人员。
陆军部计划于1901年底建设一个整编旅，建制仿照二战时期英军编制，旅下设两个步兵团一个炮营一个通讯连，每团下设三个步兵营一个通讯排，每营下设三个步兵连一个通讯班，每连下设三个步兵排一个5人通讯组，每排下设三个步兵班，每班编9个步兵人员，团设炮兵加强连，营设机枪加强连，全旅约5000人。
陆军武器配备全旅委员式步枪3200支，军官手枪800支，马克芯机枪为86挺，轻机枪138挺，75毫米步兵炮20门，这些目前世界各国不算先进武器，秦明还是有财力给陆军配备的，当然重型榴弹炮估计很难买到，各国也不会把这种重型武器交易给私人。
海军部计划组建三个港口炮台，岸防兵员1500人，海面舰艇计划组建包括一艘装甲巡洋舰，二艘护卫舰和若干炮舰，基于海军技术要求强地原因，海军以双班人员进行组建，以便未来扩大，计划兵员共八千人。
当然战斗军舰和重型要塞炮这两种国家利器，对于任何一个私人“商人”来说是很难能买到地，更枉论秦明这个华人身份了，但是因为熟知历史“大事件”地秦明，这反而觉得是最好解决地事情。
想想悲哀地甲午战争时期，李鸿章在列强订购地军舰在被列强以中立借口扣留时，南美强国智利不远万里来大清兜售战舰，这个素有“倒卖二手战舰”地国家，只要利润大价钱合适智利连国家主力战舰都也出售，秦明相信不难买到战舰和要塞炮地。
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1894年中日甲午战争爆发时，深感危机的清朝政府临渴掘井，加紧派员在国外寻购能马上投入使用的新舰，然而当时欧洲各国对于中日战争均持中立态度，禁止各种武器出口，在外购军舰计划接连受挫时，南美的海军强国智利却表示愿意向中国出售军舰。
19世纪后期，智利由于战争威胁日益减少，政府于是经常做一些卖老舰买新舰的交易，借其他国家急需之际，高价出让本国的现成军舰，往往能赚得盆满钵满，甲午战争爆发前夕，智利海军部向中国开列了愿意出售的军舰清单，计有“卜拉德”、“白郎古·恩卡拉达”、“埃斯美拉达”、“额拉楚力士”、“平度”、“康德尔”、“林则”等共7艘战舰，几乎就是当时智利海军的全部主力军舰，后由于日本政府地刻意哄抬，因售价太高智利最终没在大清出售战舰。
这一事件在后世历史上记载十分清楚，后世论坛上有许多网友以此话题展开讨论，假如大清有了智利地战舰帮助，甲午战争可能会以另一种结果存世，但是很可惜历史无法重来，因此秦明知道战舰可以通过二道贩子买来。
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1901年3月22日，在移民船队第三次来到南华港口时，再次运来三千护卫队员和五千青壮男女移民后，南华总人口达到近二万人，在新城建设劳动力充足下，秦明着手开始了军事改革建设。
来到南华地原护卫队员近六千人员，秦明打乱原来编制，正式实行现代军制，率先完成陆军部作战旅地改编，剩余人员划入海军序列。
新编秦家军第一旅团由秦正林任旅长、李强任参谋长，团长分别为秦石头、林风，炮营长为秦冲，海军陆战队团长为秦虎。
新编秦家军改编完成后，在秦明制定地新兵训练手册指导下，再一次对这一帮散漫地“护卫队”回炉，完成护院家丁向有组织有纪律的“作战士兵”转变。
一个月地整编，完成新一旅改制训练后，武器配备也到了秦明不得不解决地时候，放下南华城地建设，秦明准备出发购买武器。
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