南赣，其实就是赣、粤、闽、湘四省交界地区，崇山峻岭，属于五岭地区，这是一条东北西南走向的山脉，横亘在湖南、两广、江西之间。
明朝初年，这一地区地广人稀，瘴气弥漫，并不适合人群居住。
但是到了明朝中期，情况发生了翻天覆地的变化。
明朝中期以后，土地兼并十分严重，很多老百姓丧失了土地，这导致老百姓依靠高利贷或者迁徙他地生活，遇到歉收的年份时，老百姓成为流民，有时上万人一起拖家带口迁徙。
南赣地区土地较多，人口较少，四省的流民逐步迁徙到南赣地区生活，改变了明朝初年地广人稀的情况，他们为了躲避徭役聚集在此地，成为开发南赣地区的主力。
这些迁徙到此地的流民白天下山种地，晚上则上山为盗贼，加上早期已经住在南赣的少数民族土着，地方治安环境相当混乱，政府在这一区域疲于应付，但是收效甚微。
老百姓逃避赋税，使得税收大减，聚集于此地的流民成为当地盗贼，时不时发生动乱。
从弘治年间开始，为了剿灭南赣地区的流民作乱，明廷不仅调动周边卫所，还请了广西狼兵参战，但面对四省边界的流民遥相呼应，互相援助，也没有能够剿灭盗贼。
在这里，动乱的种子犹豫野草般，烈火烧不尽，春风吹又生。
为此，明孝宗专门设置了南赣巡抚这一职务，负责剿灭当地盗贼，控制流民，恢复地方秩序，改变地方盗贼风气。
明朝自从设立南赣以来，一直安排巡抚大员坐镇，稳定地方，最出名的应该是王阳明任职南赣巡抚时期，他剿抚并用，打击作恶的首犯。
王阳明为了约束南赣地区的民众，搞了一套“相约制度”，约束民众的行为。
设置“约”以及“约长”等职务，定期聚会，共同处理地方问题，并且建立社学、书院教化当地百姓，推动了南赣地区的发展。
王阳明的这一套做法为后来者做出了模板，南赣地区的形势逐步改变，安定下来。
南赣巡抚设立之初，以“赣州为治所，兼理南安、赣州、建昌三府，及广东之潮、惠、南雄，福建之汀州，湖广之郴州等处捕盗事宜”。
此后该职辖区不断盈缩变化，但大致还以赣州府、南安府为中心，其余辖区则以“兼辖”管理。
嘉靖三十五年时，福建汀、漳二府被划入南赣巡抚治下，不过同属南赣和福建双重管理。
但是，毕竟汀、漳二府