为昆仑洞天中没有百年期满必须飞升的限制，所以双方的战争绵延千年，跟随开明六巫进入昆仑洞天的巫教成员纷纷死去，最终只剩下开明六巫。
炼药成功之后，开明六巫又爆发内乱，巫彭、巫凡、巫相、巫履、巫抵意图杀死外人巫阳，独占长生不死之药，此时已经是大魏末年，最终是巫阳联合进入昆仑洞天的道门地仙，反杀了另外五位大巫，在交手过程中，长生不死之药有所消耗，最终道门只是得到了不完整的长生不死之药，补全不完整的萨满教版本“长生石”之后，得到三代“长生石”。
所以巫阳在道门的地位很高，是唯一被允许供奉祭祀的大巫。
另一边，巫咸与另外四位大巫也在想办法弥补不死之药的不足之处，不死之药的缺陷很明显，因为不死之药是以上古荒兽为材，不可避免地沾染了这些生灵死去时的怨念煞气。窫窳之所以会变为怪物，就是因为不死之药中残留了太多的荒兽气息，只要想办法除去这些荒兽的气息，就不会变成怪物。
不过灵山上没有能够替代荒兽的药材，只有昆仑洞天才有完善不死之药的各种药材，于是巫咸走上了另外一条道路，用人来代替荒兽。当时人皇正在征战四方，巫咸请求人皇让部下将领收集敌人的生灵之力，以此继续炼制不死之药，得出一个变种，即后来被道门否定的萨满教版本“长生石”。
玄圣曾经得到过萨满教版本的“长生石”，不过那块萨满教版本“长生石”经过天劫的洗练，已经十分衰弱，力量十不存一，后来又被巫阳以长生不死之药修补，这才没有了隐患。
简而言之，三代“长生石”是不完整的二代“长生石”加上不完整的萨满教版本“长生石”。
二代“长生石”固然完美，但缺点是难以复制。三代“长生石”较之二代“长生石”稍有不足，不能让人无视天劫，但同样没了隐患，关键是可以仿制，这才有了“长生石之心”。
二代“长生石”来自开明六巫，萨满教版本的“长生石”来自以巫咸为首的五位大巫，十一位大巫在时隔千年之后，最终还是完成了合作。
道门之所以否定萨满教版本的“长生石”，血腥残忍只是原因之一，巫咸只是用敌人的生灵之力炼药，萨满教却直接用奴隶的性命。另一个原因是这种“长生石”应该作为一件兵器或者身外之物，而不是将它当做药物。
巫咸炼药成功后，为了验证药效，决定亲自服用，结果就是她整个人都被彻底影响了，就像当年的窫窳一样。虽然她没有变成怪物，